Nytt PCR-assay gir bedre svar ved påvisning av Yersinia ruckeri

Det har den siste tiden vært økt oppmerksomhet rundt Yersinia ruckeri og mulighetene for å karakterisere bakterien nærmere. For å gjøre tolkningen av PCR-resultater enklere har PHARMAQ Analytiq ferdigvalidert et nytt assay for virulensmarkører.

Assayet påviser kjente virulensgener som er identifisert i tidligere forskningsarbeid, blant annet fra Veterinærinstituttet. Markørene er knyttet til isolater som er forbundet med sykdomsutvikling.

Fra påvisning til mer målrettet oppfølging

En positiv PCR for Y. ruckeri betyr ikke nødvendigvis at bakterien er årsak til sykdom. Det nye assayet kan bidra med en viktig tilleggsopplysning ved å avklare om kjente virulensmarkører er til stede.

I kombinasjon med CC1-analysen kan resultatene gi et bedre grunnlag for videre vurdering:

• Virulensmarkører ikke påvist: Funn av Y. ruckeri er ikke assosiert med de kjente virulensmarkørene i assayet.

• Virulensmarkører påvist: Funn av Y. ruckeri har markører som er forbundet med sykdomsutvikling.

• CC1-resultatet: Analysen kan vise om bakterien tilhører CC1 eller ikke.

Resultatene må alltid tolkes sammen med kliniske funn, sykdomsbilde, historikk og øvrige laboratorieresultater. PCR-analysene sier ikke noe om serotype.

Slik bestiller du analysen

Kunder kan bestille analysen på vanlig måte gjennom iWISE når det sendes inn PCR-prøver. Prøvesvaret vil forklare hva resultatene betyr, slik at funnene blir enklere å bruke i den videre oppfølgingen.

Ved bakteriologiinnsendinger der det er vekst av Y. ruckeri på skål, vil mikrobiologilaboratoriet sette opp både CC1-assay og assayet for virulensmarkører. Resultatene vil også følges av en tydelig forklaring.

Serotype og vaksinebeskyttelse må vurderes separat

Det er viktig å skille mellom typing av virulensmarkører og analyser for serotype. PCR-assayene kan ikke alene avklare hvilken serotype bakterien tilhører, eller om en vaksine forventes å gi beskyttelse mot det aktuelle isolatet.

Når det er behov for å avklare serotype og mulig vaksinebeskyttelse, må isolater sendes til PHARMAQ Analytiq på Skøyen. Der kan det, etter avtale i hvert enkelt tilfelle, settes opp analyser som skiller mellom blant annet O1b og O2, for eksempel ELISA eller Western blot.

Historisk har O1b, som oftest grupperer seg i CC1, vært isolert fra laks med ERM-sykdom i Norge. PHARMAQ ERM-vaksinen gir beskyttelse mot O1b og har også vist kryssbeskyttelse mot O1a ved injeksjon. Enkelttilfeller av sykdom har vært assosiert med O2, som har vært gruppert i CC3.

Et verktøy for raskere og bedre beslutningsstøtte

Det nye assayet gir PHARMAQ Analytiq et mer komplett verktøy for oppfølging av Y. ruckeri-funn. Målet er å gi kundene tydeligere svar og et bedre grunnlag for å vurdere hvilke analyser og tiltak som er relevante i den enkelte situasjonen.

For spørsmål om bestilling, prøvemateriale eller tolkning av resultater, ta kontakt med PHARMAQ Analytiq.